Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm1Q60636 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm1Q60636 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm1Q60636 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm1Q60636 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm1Q60636 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms