Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema5bQ60519 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema5bQ60519 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5bQ60519 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema5bQ60519 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5bQ60519 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms