Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPH3

4930438A08Rik, Amine oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930438A08RikQ5SPH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4930438A08RikQ5SPH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930438A08RikQ5SPH3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930438A08RikQ5SPH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930438A08RikQ5SPH3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms