Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms