Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa1Q5EG47 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa1Q5EG47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prkaa1Q5EG47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa1Q5EG47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms