Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Khdc1cQ4KL78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Khdc1cQ4KL78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Khdc1cQ4KL78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms