Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx25Q3ZT31 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx25Q3ZT31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx25Q3ZT31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx25Q3ZT31 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx25Q3ZT31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms