Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm29609Q3UU56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm29609Q3UU56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm29609Q3UU56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29609Q3UU56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms