Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Znf48Q3US17 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Znf48Q3US17 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf48Q3US17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf48Q3US17 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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