Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln5Q3UMW8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln5Q3UMW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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