Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch2Q3UMG5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch2Q3UMG5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms