Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog7Q3UM29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cog7Q3UM29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog7Q3UM29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms