Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf224Q3UIW8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf224Q3UIW8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf224Q3UIW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf224Q3UIW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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