Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lmod2Q3UHZ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Lmod2Q3UHZ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Lmod2Q3UHZ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lmod2Q3UHZ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lmod2Q3UHZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lmod2Q3UHZ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmod2Q3UHZ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms