Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmd8Q3UFK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd8Q3UFK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd8Q3UFK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd8Q3UFK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms