Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vars2Q3U2A8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vars2Q3U2A8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vars2Q3U2A8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Vars2Q3U2A8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms