Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ogfod1Q3U0K8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ogfod1Q3U0K8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ogfod1Q3U0K8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ogfod1Q3U0K8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ogfod1Q3U0K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ogfod1Q3U0K8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ogfod1Q3U0K8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms