Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYE7

Tmem136, Transmembrane protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem136Q3TYE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem136Q3TYE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem136Q3TYE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem136Q3TYE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms