Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trmt1Q3TX08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trmt1Q3TX08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trmt1Q3TX08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt1Q3TX08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trmt1Q3TX08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms