Protein–RNA interactions for Protein: Q3TV70

Nr2c2ap, Nuclear receptor 2C2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c2apQ3TV70 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr2c2apQ3TV70 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2c2apQ3TV70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2c2apQ3TV70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr2c2apQ3TV70 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2c2apQ3TV70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2c2apQ3TV70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2c2apQ3TV70 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms