Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUA9

Pomk, Protein O-mannose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomkQ3TUA9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PomkQ3TUA9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PomkQ3TUA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PomkQ3TUA9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PomkQ3TUA9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms