Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TTL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q3TTL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3TTL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms