Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp39Q3TIX9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp39Q3TIX9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp39Q3TIX9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp39Q3TIX9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms