Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2f1Q3THK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2f1Q3THK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gtf2f1Q3THK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms