Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prok1Q14A28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prok1Q14A28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prok1Q14A28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prok1Q14A28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms