Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col19a1Q0VF58 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col19a1Q0VF58 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Col19a1Q0VF58 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms