Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpne7Q0VE82 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne7Q0VE82 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne7Q0VE82 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne7Q0VE82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms