Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap5aQ0V8T9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5aQ0V8T9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5aQ0V8T9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5aQ0V8T9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5aQ0V8T9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms