Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pate4Q09098 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pate4Q09098 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms