Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff1Q08423 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff1Q08423 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff1Q08423 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms