Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MestQ07646 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MestQ07646 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MestQ07646 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MestQ07646 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MestQ07646 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MestQ07646 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MestQ07646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MestQ07646 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MestQ07646 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MestQ07646 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MestQ07646 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MestQ07646 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MestQ07646 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MestQ07646 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MestQ07646 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MestQ07646 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MestQ07646 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MestQ07646 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MestQ07646 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MestQ07646 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MestQ07646 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MestQ07646 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MestQ07646 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MestQ07646 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MestQ07646 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MestQ07646 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MestQ07646 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MestQ07646 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MestQ07646 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MestQ07646 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MestQ07646 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MestQ07646 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MestQ07646 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MestQ07646 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MestQ07646 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MestQ07646 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MestQ07646 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MestQ07646 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MestQ07646 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MestQ07646 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MestQ07646 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MestQ07646 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MestQ07646 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MestQ07646 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MestQ07646 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MestQ07646 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MestQ07646 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MestQ07646 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MestQ07646 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MestQ07646 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MestQ07646 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MestQ07646 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MestQ07646 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms