Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col9a2Q07643 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col9a2Q07643 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col9a2Q07643 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col9a2Q07643 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms