Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r236Q05A06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r236Q05A06 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r236Q05A06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms