Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YEN1YER041W 2280 nt6.6□□□□□ -1.35
YMR226CQ05016 DYS1YHR068W 1164 nt6.59□□□□□ -1.35
YMR226CQ05016 FCY22YER060W-A 1593 nt6.58□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 HAL5YJL165C 2568 nt6.58□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YDR476CYDR476C 675 nt6.58□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 SKI2YLR398C 3864 nt6.58□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YKR032WYKR032W 315 nt6.57□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 ADH5YBR145W 1056 nt6.57□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 NAS6YGR232W 687 nt6.56□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YML122CYML122C 381 nt6.56□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YPQ2YDR352W 954 nt6.55□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YJR107WYJR107W 987 nt6.55□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 GPA1YHR005C 1419 nt6.55□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 MIP1YOR330C 3765 nt6.55□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YPR204WYPR204W 3099 nt6.54□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 YDL177CYDL177C 513 nt6.54□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.54□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 TPK1YJL164C 1194 nt6.54□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 NFS1YCL017C 1494 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 MPE1YKL059C 1326 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 KNS1YLL019C 2214 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 ATP23YNR020C 813 nt6.53□□□□□ -1.36
YMR226CQ05016 ISC1YER019W 1434 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 ADE17YMR120C 1779 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 URH1YDR400W 1023 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 DOC1YGL240W 753 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YUR1YJL139C 1287 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 AIM33YML087C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 VBA5YKR105C 1749 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 NAF1YNL124W 1479 nt6.52□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 TUB1YML085C 1344 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YMR034CYMR034C 1305 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YDR415CYDR415C 1125 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 SPG5YMR191W 1122 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YNL200CYNL200C 741 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 TOS6YNL300W 309 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 SES1YDR023W 1389 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 TOS1YBR162C 1368 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 PRP2YNR011C 2631 nt6.51□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YSC83YHR017W 1158 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YIA6YIL006W 1122 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 COX5AYNL052W 462 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 IRC11YOR013W 471 nt6.5□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 ARG81YML099C 2643 nt6.49□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 NMD5YJR132W 3147 nt6.49□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 NTE1YML059C 5040 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 RBS1YDL189W 1374 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 HGH1YGR187C 1185 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YHC3YJL059W 1227 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 FUS3YBL016W 1062 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 YKR023WYKR023W 1593 nt6.48□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 AVT4YNL101W 2142 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 PMT3YOR321W 2262 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 PTC7YHR076W 1032 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 CBR1YIL043C 855 nt6.47□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 SGV1YPR161C 1974 nt6.46□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 PLB2YMR006C 2121 nt6.46□□□□□ -1.37
YMR226CQ05016 REC107YJR021C 945 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 YOR300WYOR300W 309 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 YBR113WYBR113W 483 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 CEF1YMR213W 1773 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 BRN1YBL097W 2265 nt6.46□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 RGT2YDL138W 2292 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 YPT1YFL038C 621 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 RPL31BYLR406C 342 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 HEM1YDR232W 1647 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 NOG2YNR053C 1461 nt6.45□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 HSM3YBR272C 1443 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 TKL2YBR117C 2046 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 NTG2YOL043C 1143 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 VMA2YBR127C 1554 nt6.44□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 GET4YOR164C 939 nt6.43□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 YHR020WYHR020W 2067 nt6.42□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 MRPS28YDR337W 861 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 MIA40YKL195W 1212 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 PAU21YOR394W 495 nt6.41□□□□□ -1.38
YMR226CQ05016 PAU22YPL282C 495 nt6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.2 ms