Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crisp1Q03401 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp1Q03401 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Crisp1Q03401 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms