Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ascl1Q02067 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms