Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga4Q00651 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga4Q00651 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga4Q00651 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga4Q00651 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga4Q00651 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms