Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a1P70414 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8a1P70414 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc8a1P70414 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8a1P70414 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms