Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema3eP70275 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema3eP70275 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3eP70275 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3eP70275 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3eP70275 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms