Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Plxna1P70206 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxna1P70206 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna1P70206 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna1P70206 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms