Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lsm3P62311 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm3P62311 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm3P62311 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm3P62311 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lsm3P62311 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lsm3P62311 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm3P62311 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms