Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd6P61407 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd6P61407 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd6P61407 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd6P61407 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms