Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubgcp3P58854 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubgcp3P58854 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp3P58854 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp3P58854 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms