Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gsc2P56916 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gsc2P56916 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gsc2P56916 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gsc2P56916 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms