Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp5P56399 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp5P56399 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp5P56399 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp5P56399 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp5P56399 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp5P56399 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp5P56399 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp5P56399 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp5P56399 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp5P56399 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp5P56399 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms