Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc13P50207 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13P50207 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxc13P50207 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc13P50207 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms