Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc3P49135 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc3P49135 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms