Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx2-5P42582 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-5P42582 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-5P42582 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms