Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd63P41731 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd63P41731 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd63P41731 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd63P41731 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd63P41731 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd63P41731 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd63P41731 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd63P41731 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd63P41731 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd63P41731 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd63P41731 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd63P41731 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd63P41731 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd63P41731 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd63P41731 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd63P41731 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd63P41731 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd63P41731 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd63P41731 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd63P41731 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd63P41731 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd63P41731 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd63P41731 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd63P41731 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd63P41731 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd63P41731 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms