Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighmbp2P40694 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighmbp2P40694 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighmbp2P40694 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms